Universidade Federal de Viçosa

Programa de Pós Graduação em Genética e Melhoramento

                               

 

 

SEMINÁRIO DE TESE

 

Doutorando: Leonardo Lopes Bhering

Orientador: Prof. Cosme Damião Cruz

 

Genômica Aplicada a Famílias de Irmãos Completos

 

O estabelecimento de mapas genéticos em populações exogâmicas apresenta determinadas complicações não encontradas ao utilizar populações endogâmicas. Dentre elas tem-se variação no número de alelos segregando por loco, e geralmente há desconhecimento da fase de ligação. O método mais utilizado para a estimação da porcentagem de recombinação é o método da máxima verossimilhança (MV). Em famílias de irmãos completos diferentes graus de informações são observados na progênie, podendo esta ser do tipo completamente informativa ou não informativa. Uma vez obtida as freqüências de recombinações entre as marcas, inicia-se a construção do mapa genético. O mapeamento genético facilita o trabalho de melhoramento uma vez que uma ou mais marcas do genótipo podem ser associadas a genes controladores de características qualitativas e quantitativas (QTL). Porém um dos fatores de fundamental importância para se obter dados consistentes em um trabalho de mapeamento é o tamanho da amostra ou população a ser trabalhada. Para entender um pouco mais de toda teoria de genômica aplicada a populações exogâmicas foi realizado alguns estudos utilizando Famílias de Irmãos Completos (FIC). Através da simulação procurou-se discutir as diferenças existentes no mapeamento envolvendo populações com diferentes graus de informação. Para isto foi simulado um genoma constituído de três grupos de ligação, sendo cada um constituído de 11 marcas moleculares multialélicas, codominantes, eqüidistantes, com saturação de 10 cM. A partir deste genoma foram simulados dois cenários, sendo um com genitores completamente informativos, e outro com genitores formados aleatoriamente. Após a obtenção de todas as estimativas da freqüência de recombinação conclui-se que para locos completamente informativos pode-se calcular a freqüência de recombinação entre pares de locos a partir da freqüência gamética de cada genitor ou a partir da freqüência genotípica da progênie. Para locos parcialmente informativos a obtenção da freqüência de recombinação a partir da freqüência genotípica conjunta é mais apropriada. Dando continuidade a pesquisa foi realizado um estudo para tentar achar um tamanho ótimo de populações para estudo de mapeamento genético de famílias de irmãos completos. Foram simulados genomas parentais e amostras de populações de família de irmãos completos do tipo completamente informativa, e também  que não fossem completamente informativas. As amostras geradas foram de tamanho 100, 200, 400 e 600 indivíduos com 100 repetições por amostra. Concluiu-se que para populações completamente informativas um tamanho populacional de 200 indivíduos seria o suficiente para resgatar as informações originais, contudo, para a população não completamente informativa seria necessário a utilização de uma população maior, constituída de 600 indivíduos.