Universidade Federal de Viçosa

Programa de Pós Graduação em Genética e Melhoramento

Seminário de Tese

                              

TÍTULO: ANÁLISES BIOMÉTRICAS EM ESTUDO SIMULADO SOBRE A DIVERSIDADE GENÉTICA DE POPULAÇÕES DE MELHORAMENTO A PARTIR DE INFORMAÇÕES DE MARCADORES CODOMINANTES

 

PRELECIONISTA: Fábio Medeiros Ferreira

ORIENTADOR: Cosme Damião Cruz

CONSELHEIROS: Pedro Crescêncio Souza Carneiro e Luiz Antônio dos Santos Dias

 

RESUMO

 

O estudo da diversidade genética visa elucidar as relações genéticas, quantificar ou predizer o nível de variabilidade genética existente e verificar a sua distribuição entre e/ou dentro de populações ou espécies. Este conhecimento têm proporcionado importantes contribuições no melhoramento genético, no gerenciamento de bancos de germoplasma, na conservação de recursos genéticos e no entendimento dos processos evolutivos das espécies. No melhoramento tem auxiliado o planejamento de estratégias mais eficazes que venham a maximizar os ganhos genéticos, como a identificação de combinações parentais adequadas à obtenção de híbridos altamente heteróticos, que possibilitem maior segregação em recombinações, com o aparecimento de transgressivos e a introgressão de genes favoráveis proveninentes dos acessos dos bancos de germoplasma detentores da base genética da espécie alvo. Nos bancos de germoplasma a análise da diversidade pode ajudar a classificar corretamente um acesso, identificar duplicatas e subgrupos de coleções núcleo. Embora o nível de polimorfismo dentro de espécies seja óbvio a partir da variação de características morfológica, a avaliação quantitatitativa da variação genética tomou novos rumos após o desenvolvimento de técnicas de biologia molecular, criando perspectivas na pesquisa de conservação de espécies e biologia populacional. Os marcadores moleculares (e bioquímicos), em especial os codominantes, tem permitido a caracterização da estrutura e da diversidade genética de populações. Os fenômenos evolutivos e genéticos atuantes nas populações de melhoramento já estão bem esclarecidos pela Genética de Populações e Quantitativa. No entanto, um estudo de simulação capaz de contextualizar tais eventos de maneira mais próxima da realidade das populações. Ao mesmo tempo é possível inferir sobre vários tipos de populações, número finito de indivíduos (pequeno ou grande) e vários locos. Ainda permite testar hipóteses sob diferentes modelos genéticos e a adequação de metodologias. Dentro deste contexto, objetivou-se inferir sobre a estrutura e a variabilidade genética de populações de melhoramento submetidas a processos de acasalamento ao acaso, hibridação, autofecundações e retrocruzamentos a partir de informações de marcadores codominantes multialélicos e comparar medidas de diversidade genética. Foram simuladas três populações-base de tamanho finito, cada uma composta por 200 indivíduos e 20 locos codominantes e multialélicos, sendo eles monomórficos e polimórficos ao nível intra e interpopulacional. Cada loco tinha de um a cinco alelos, dentro de cada população. Os locos assumiam estar em equilíbrio de Hardy-Weinberg. Foram simuladas mais 39 populações, derivadas de hibridação, retrocruzamento, autofecundação e acasalamento ao acaso, a partir das três populações-base, totalizando 42 populações. Todo o processo de simulação e codificação dos dados foi realizado pelo programa Genes (Cruz, 2006). Foram utilizados os aplicativos Genes, GDA (Lewis e Zaykin, 2001) e Power Marker (Liu, 2005) para realização das análises. As populações-base e as gerações de acasalamento ao acaso encontraram-se em equilíbrio de Hardy-Weinberg para a grande maioria dos locos. Conforme o esperado, o equilíbrio de Hardy-Weinberg não foi observado nas populações F2, F3 e F4 e de autofecundação. Nas populações de retrocruzamento, a grande maioria dos locos não se encontra em equilíbrio de Hardy-Weinberg. Observou-se nas populações de acasalamento ao acaso, que com os avanços das gerações, o desequilíbrio gamético tendeu a diminuir entre os pares de locos. A análise da variabilidade genética dentro das populações, realizada com algumas medidas descritivas e índices de diversidade, mostrou que as populações híbridas e as gerações Fn foram as que mais apresentaram alelos por loco, mais alelos em locos polimórficos e alelos raros, na média dos locos. A heterozigosidade observada manteve-se aproximadamente constante com os avanços das gerações de acasalamento ao acaso. À medida que as gerações Fn avançaram, a heterozigosidade observada diminuiu. Com os avanços das gerações de autofecundação houve uma tendência do índice de fixação (coeficiente de endogamia) aumentar e a riqueza genotípica destas populações decrescerem assim como sua heterozigosidade observada. As populações da primeira geração de retrocruzamento, cujo progenitor recorente era a população-base 3, e os híbridos entre as população-base 2 x 3, foram as que apresentaram maior riqueza genotípica, provavelmente em função da contribuição heterozigota da população 3. A correlação entre os valores de conteúdo médio de informação polimórfica (PIC) e heterozigosidade esperada com o índice de fixação apresentaram correlação nula. O índice de fixação apresenta-se altamente correlacionado, porém negativo, com a heterozigosidade observada. A análise da diversidade genética entre as populações estudadas com várias medidas de distância genéticas e genotípica mostrou que o agrupamento das populações ocorreu conforme o esperado para todas as medidas de distância utilizadas. Populações cuja hibridação ocorreu planta a planta ou por mistura de pólen foram agrupadas muito próximas e, praticamente não diferiram. As populações de retrocruzamento foram agrupadas próximas ao seu progenitor recorrente. As populações oriundas das populações-base formaram grandes grupos com suas respectivas populações-base. As medidas de distância se mostraram altamente correlacionadas (> 0,94). Pela análise de variância da heterozigosidade (Weir 1996), não houve diferença significativa entre as populações, embora entre os locos esta diferença de heterozigosidade tenha sido significativa (P < 0,05). O estudo simulado com as várias populações de melhoramento permitiu visualizar o comportamento genético das mesmas quanto as suas respectivas estruturas genéticas e quanto a diferenciação ou similaridade existente entre elas, ao longo das várias gerações de acasalamento.

                 

Literatura Sugerida:

 

Cruz, C.D. Programa Genes: Análise multivariada e simulação. Editora UFV. Viçosa (MG). 175p. 2006

 

Dias, L. A. S. Análises multidimensionais. In: Alfenas, A.C. (ed) Eletroforese de isoenzimas e proteínas afins. Ed. UFV, Viçosa-MG,1998, p. 405-475.

 

Hartl, D.L. and Clark, A.G. 1997. Principles of population genetics. 3ed. Sunderland (MA): Sinauer Associates.

 

Lewis, P. O., and Zaykin, D. 2001. Genetic Data Analysis:  Computer program for the analysis of allelic data.  Version 1.0 (d16c). Free program distributed by the authors over the internet from http://hydrodictyon.eeb.uconn.edu/people/plewis/software.php.

 

Liu, J. Powermarker v3.0 Manual. 2005, 32 p. http://statgen.ncsu.edu/powermarker/downloads.htm.

 

Nei, M.; Kumar, S. Molecular evolution and phylogenetics. Oxford University Press, New York, 2000. 333p.

 

Weir, B. S. Genetic data analysis II. 2. ed. Sinauer Assoc., Massachusetts, 1996. 445p.