Universidade Federal de Viçosa

Programa de Pós Graduação em Genética e Melhoramento

Seminário de Tese

Identificação de ESTs potencialmente relacionadas com a resistência do cafeeiro a doenças

Aluno: Samuel Mazzinghy Alvarenga

Orientador: Prof. Ney Sussumu Sakiyama

Co-orientadoras: Dra. Eveline Teixeira Caixeta e Dra. Eunize Maciel Zambolim

A partir das informações geradas no Projeto Brasileiro do Genoma Café (PBGC) foram identificadas, por meio de análise in silico, seqüências potencialmente envolvidas na resistência do cafeeiro a doenças.

O trabalho de mineração de dados foi efetuado na plataforma de bioinformática desenvolvida pelo Laboratório de Genômica e Expressão (LGE). Diferentes estratégias foram usadas para minerar as seqüências de interesse. Inicialmente, palavras-chave que correspondem a termos relacionados aos mecanismos de resistência de plantas a patógenos foram obtidas da literatura e utilizadas como “iscas” para mineração dos dados. Projetos englobando as ESTs (Expressed Sequence Tags) relacionadas a cada uma destas palavras foram criados. Outra estratégia utilizada foi a busca por similaridades entre algumas seqüências envolvidas com a resistência do cafeeiro a doenças já publicadas com as seqüências do PBGC, por meio do algoritmo BLAST. A terceira estratégia baseou-se na utilização da ferramenta “Electronic Northern”. A mineração, usando as três estratégias, resultou na identificação de 13.388 seqüências do PBGC.

Com o objetivo de verificar o envolvimento destas seqüências com a resistência à ferrugem, principal doença do cafeeiro, 40 pares de primers específicos foram desenhados e, posteriormente, testados quanto à estabilidade. Utilizando as condições de reação e amplificação previamente otimizadas, os primers foram testados em 12 genótipos resistentes e 12 susceptíveis ao fungo causador da ferrugem. Destes, 29 resultaram em bandas únicas e bem definidas, sendo um polimórfico, capaz de distinguir os indivíduos resistentes dos susceptíveis. Esse marcador molecular desenvolvido amplifica uma região do DNA que está potencialmente associada ao domínio LRR de proteína de resistência a doenças. Para confirmar a possível ligação e seu potencial, o marcador será testado em diferentes populações do Programa de Melhoramento da UFV/EPAMIG.

Referências Bibliográficas:

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