Capítulo 4 – COMPONENTES DE VARIÂNCIA

 

 

1) Deduza as seguintes propriedades de variâncias e covariâncias baseando-se em esperança matemática:

a) V (kX) = k² V (X)

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b) V (x) = 1 sendo  Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image008.png

 

               

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Como:

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Temos:

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c) V (X+Y) = V(X) + V(Y) + 2 Cov (X,Y)

 

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d) COV (X,X) = V (X)

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e) Cov (aX, bY) = abCov(X,Y)

 

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Como:

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Temos:

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2) Considerando as propriedades de variância e covariância, com base em esperança matemática, como seria dada a V (aX+bY).

 

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1)

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2)

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Temos:

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3) Foram avaliadas dez famílias de meios-irmãos em experimentos em blocos ao acaso com três repetições. O resultado da análise de variância é representado a seguir:

 

FV

GL

SQ

QM

F

 

Probabilidade

Bloco (B)

2

713,216

356,6

 

 

 

Tratamentos

9

6384,823

709,4

4,8238

 

0,002228

Resíduo

18

2647,224

147,1

 

 

 

Média

 

146,63

CV(%)

 

8,28

 

Minimo

 

112,1

Máximo

 

185

 

 

- As médias das famílias foram:

129,3 ; 154,4 ; 141,5 ; 165,6 ; 145,7 ; 116,7 ; 139,0 ; 149,9 ; 164,3 ; 156,9.

 

- Considere os resultados da análise de variância:

 

a)      Estime a variância genética e a herdabilidade considerando a seleção baseada nas médias das famílias.

 

FV

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E (QM)

Bloco (b)

x

 

x

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Genótipo (g)

x

x

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image056.png

Resíduo

x

 

 

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Variância genética:

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Herdabilidade:

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b)      Estime o ganho a ser obtido pela seleção das quatro melhores famílias

 

Como já temos o valor da herdabilidade (0,7926), basta encontrarmos o valor do diferencial de seleção para calcularmos o ganho com a seleção.  A média de todas as famílias é 146,33, precisamos apenas da média dos selecionados.

 

Passo 1) Identificação das quatro famílias com maiores médias:

 

165,6; 164,3; 154,4 e 156,9.

 

Passo 2) Cálculo da média das melhores famílias:

 

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Passo 3) Cálculo do diferencial de seleção (DS):

 

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Passo 4) Cálculo do ganho de seleção (GS):

 

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c)       Faça a predição da média da população melhorada

 

A média da população melhorada é dada pela soma da média original com o ganho de seleção:

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4) Defina efeito fixo e aleatório

 

O Efeito é dito fixo quando as conclusões a seu respeito forem válidas somente para ele próprio. O tratamento estudado não é uma amostra, mas sim o próprio material de interesse. Exemplo: ensaios de competição e recomendação de cultivares.

 H0: g1 = g2=...= gn = 0 (Teste F significativo indica a existência de diferença entre as médias, o que possibilita o uso de testes de média).

E (gi) = gi

E (gi2) = gi²

Σgi = k =0

 

O efeito é dito aleatório quando o material avaliado constitui-se numa amostra de uma população, de forma que as informações obtidas têm o interesse de caracterizar a população de trabalho. Exemplo: avaliação de progênies (meio irmão e irmão completo, por exemplo).

H0: δ²g = 0 (Teste F significativo indica a existência de variabilidade genética entre as médias testadas)

E (gi) = 0

E (gi2) =δg ²

E (gi , gi’) = 0

 

5) Defina componente de variância

 

Componentes de variâncias são as variâncias associadas aos efeitos aleatórios de um modelo estatístico. Neste modelo, a média sempre é fixa e o erro aleatório. A importância desse estudo, é para obtenção do estimador da variância genotípica e de seus componentes herdáveis e não herdáveis.

 

6) Qual a diferença entre um componente de variância e um componente quadrático.

 

                O componente quadrático expressa a variabilidade genotípica existente no material genético estudado, quando se trabalha com efeito fixo. Ressalta-se que para efeito fixo, nossa hipótese H0 testa a igualdade entre contrastes de médias. Já o componente de variância, expressa a variabilidade genética do material estudado, quando consideramos efeito aleatório. Nossa hipótese H0 para esse tipo de caso é se a δ²g é igual a zero, sendo que essa variância ainda pode ser subdivida em seus componentes básicos (variância aditiva e devida aos desvios de dominância).

               

7) Considere o modelo Yij = m + Gi + Bj + Eij

 

 a) Apresente o quadro da análise de variância, com as fontes de variações e respectivas esperanças do quadrado médio.

 

FV

GL

SQ

QM

F

Genótipos (G)

g-1

SQG

QMG

QMG/QMR

Bloco (B)

b-1

SQB

QMB

 

Resíduo

(g-1) (b-1)

SQR

QMR

 

Total

rga-1

SQT

 

 

 

 

Obtenção da E (SQ) e QM considerando Efeito Aleatório:

 

E (gi) = 0                              E (bj) = 0

 

E (gi2) =δg ²                         E (bj2) =δb ²

 

E (gi , gi’) = 0                       E (bj ,bj’) = 0

 

SOMA DE QUADRADOS

 

SQTotal:

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(1)

 

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(2)

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Temos:

 

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SQTratamento :

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(3)

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Temos:

 

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SQBlocos:

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(4)

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Temos:

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ESPERANÇAS DE QUADRADO MÉDIO (SQ/GL)

 

Método Prático

 

FV

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E (QM)

Bloco (b)

x

 

x

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image055.png

Genótipo (g)

x

x

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image056.png

Resíduo

x

 

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image052.png

 

 

b) Considerando o efeito do genótipo (Gi) fixo, descreva a hipótese testada no modelo. Que conclusões o pesquisador pode tirar quando obtiver valor de F ( = QMG/QMR) significativo.

 

                Na análise de variância para o modelo fixo, tem-se que H0: g1=g2=g3=...= gn=0. Logo o valor significativo obtido pelo teste F indica a existência de efeito significativo de genótipo ou que há pelo menos um contraste entre as médias avaliadas que diferem estatisticamente entre si, tendo por base o teste de Scheffé. Dessa forma, é possível o pesquisador realizar testes de médias.

Os resultados só servem para os tratamentos analisados.

 

c) Considerando o efeito do genótipo (Gi) aleatório, descreva a hipótese testada no modelo. Que conclusões o pesquisador pode tirar quando obtiver valor de F (= QMG/QMR) significativo.

 

Na análise de variância para o modelo aleatório, tem-se que H0: δ²g = 0. Logo o valor significativo obtido pelo teste F indica a existência de efeito significativo de variância genotípica (variabilidade genética) entre as médias testadas, indicando viabilidade do uso de técnicas seletivas.

Os resultados podem ser expandidos.

 

d)      Deduza a esperança de E (Y..)² e de E (Yi.²)

 

Passo 1) Dedução de E(Y..)2

 

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Passo 2) Dedução de E (Y2i.)

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8) Considerando os dados a seguir, faça a análise de variância e apresente os testes de hipóteses considerando o modelo aleatório. Estime a variância genética e a herdabilidade do caráter.

 

Genótipo

Bloco 1

Bloco 2

Bloco 3

Total

1

12

14

16

42

2

15

14

18

47

3

20

22

19

61

4

30

32

30

92

Total

77

82

83

242

 

Modelo Yij = m + Gi + Bj + Eij

 

Para fazer esse exercício devemos primeiramente calcular a soma de quadrado total, soma de quadrado de blocos e soma de quadrado genótipo:

 

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Agora podemos montar o quadro da ANOVA:

FV

GL

SQ

QM

F

Bloco (B)

(r-1) = 2

5,16

2,58

 

Genótipos (G)

(g -1) = 3

505,66

168,55

53,69**

Resíduo

( r-1) (g-1) = 6

18,83

3,136

 

Total

11

529,66

 

 

 

Sendo que:

GL Resíduo = GL Total – GL Blocos – GL Genótipos

 

Método Prático para obtenção de E (QM):

FV

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E (QM)

Bloco (b)

x

 

x

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Genótipo (g)

x

x

 

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Resíduo

x

 

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image052.png

 

A variância genética é dada por:

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E a herdabilidade por:

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9) Considere os resultados da análise de variância feita segundo o modelo:

 

Yijk = m + B/Ajk + Gi + Aj + GAij + Eijk

 

FV

GL

QM

Bloco/Ambiente

27

1,523

Genótipos

4

12,119

Ambiente

8

42,886

G x A

32

4,039

Resíduo

108

0,456

 

a)      Apresente as E (QM) considerando o modelo aleatório

 

Método Prático para obtenção da E (QM):

 

1)      Confeccionar uma tabela de dupla entrada com FV e componentes de variância;

 

 

2)      Incluir coeficientes multiplicando os componentes de variância, exceto o da fonte de variação testada;

 

3)      Incluir os componentes que possuem todas as letras da FV.

 

 

FV/COMPONENTES

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E (QM)

E(QM) Fixo

Bloco/ambiente

x

x

 

 

 

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Genótipo

x

 

X

 

x

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Ambiente

x

x

 

x

x

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G x A

x

 

 

 

x

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Resíduo

x

 

 

 

 

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b)      Apresente as hipóteses a serem testadas.

 

                Para o modelo aleatório, testa-se uma hipótese para cada componente de variância, por exemplo, o valor de δ²g , sendo nossa hipótese H0 igual a δ²g=0. Para isso, é importante isolar cada componente de interesse.

 

FV/COMPONENTES

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E (QM)

Teste F

Hipótese

Bloco/ambiente

X

x

 

 

 

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Genótipo

X

 

x

 

X

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Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image149.png 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image150.png

Ambiente

X

x

 

x

X

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Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image151.png 

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G x A

X

 

 

 

X

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Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image153.png 

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Resíduo

X

 

 

 

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image052.png

 

 

 

c) Apresente os valores da estatística F e sua significância.

 

FV

Teste F

Probabilidade

Genótipo

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image155.png 

3,28%*

Ambiente

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image156.png 

0%**

G x A

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image157.png 

0%**

 

 

d) Estime o δ²g e δ²ga. Estime a herdabilidade considerando a seleção baseada nas médias dos genótipos nos vários ambientes.

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image158.png

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image159.png

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image160.png

 

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image161.png

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image162.png

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image163.png

 

e) Por que os graus de liberdade associados a genótipos e genótipos x ambientes são, respectivamente, g-1 e (g-1) (a-1)?

 

O grau de liberdade associado a genótipos é g-1 porque é perdido um grau de liberdade devido a média genotípica, enquanto o associado a genótipos x ambientes é (g-1) (a-1) porque são perdidos dois graus de liberdade, um devido a média genotípica e outro devido a média do ambiente.

 

f) Responda todas as questões considerando agora o modelo misto (com efeito de ambiente fixo e os demais aleatórios).

 

Método Prático para obtenção da E (QM) em modelos mistos:

1)      Confeccionar a E (QM) para o modelo aleatório;

 

2) Fazer alterações na tabela:

                a) Substituir δ²x por Φx no efeito fixo (grδ²a "grΦa);

 

b)      Adicionar α na interação fixo-ambiente (rδ²ag "rαδ²ag);

 

                c) Excluir o efeito aninhado após a “/” (gδ²b/a"gδ²b).

 

3) Permanece no modelo o componente que explica a FV ou que ao retirar a FV testada sobra efeito aleatório.

 

FV/COMPONENTES

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image052.png

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image054.png

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image137.png

grΦa

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image164.png

E (QM)

Teste F

Bloco/ambiente

x

x

 

 

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image165.png

 

Genótipo

x

 

x

 

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image166.png

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image167.png 

Ambiente

x

x

 

x

x

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image168.png

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image151.png 

G x A

x

 

 

 

x

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image169.png

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image153.png 

Resíduo

x

 

 

 

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image052.png

 

 

 

FV

Teste F

Probabilidade

Genótipo

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image170.png 

0%**

Ambiente

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image156.png 

 

G x A

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image157.png 

0%**

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image171.png

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image172.png

 

10) Considere um experimento em blocos ao acaso com r repetições, em que se avaliaram g genótipos e a ambientes. Admita que os efeitos de genótipos são fixos.

 

a) Apresente o esquema da ANOVA com graus de liberdade e esperança dos quadrados médios.

 

Yijk = m + Gi + Aj + GAij + B/Ajk + Eijk

G = fixo

A e B = aleatório

 

FV/COMPONENTES

GL

SQ

QM

E (QM)

Bloco/ambiente

a (r-1)

SQB

QMB

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image055.png

Genótipo

(g-1)

SQG

QMG

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image173.png

Ambiente

(a-1)

SQA

QMA

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image174.png

G x A

(g-1) (a-1)

SQGA

QMGA

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image169.png

Resíduo

(r-1) (g-1)a

SQR

QMR

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image052.png

Total

gra-1

 

 

 

 

Método Prático para obtenção da E (QM) em modelos mistos:

 

1)      Confeccionar a E (QM) para o modelo aleatório;

 

2)      Fazer alterações na tabela:

 

a)      Substituir δ²x por Φx no efeito fixo (arδ²g "arΦg);

 

b)      Adicionar α na interação fixo-ambiente (rδ²ag "rαδ²ag);

 

                c) Excluir o efeito aninhado após a “/” (gδ²b/a"gδ²b).

 

3) Permanece no modelo o componente que explica a FV ou que ao retirar a FV testada sobra efeito aleatório.

 

FV/COMPONENTES

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image052.png

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image054.png

raΦg

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image175.png

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image164.png

E (QM)

Teste F

Bloco/ambiente

x

x

 

 

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image055.png

 

Genótipo

x

 

x

 

x

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image173.png

QMG/QMGA

Ambiente

x

x

 

x

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image174.png

QMA/QMB

G x A

x

 

 

 

x

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image169.png

QMGA/QMR

Resíduo

x

 

 

 

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image052.png

 

 

b)      Apresente os estimadores dos componentes de variância associados aos efeitos de ambientes e da interação genótipo x ambiente.

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image176.png

 

11) Os resultados da análise de variância de experimentos realizados em três locais são apresentados a seguir:

 

 

 

A1

A2

A3

FV

GL

QM

GL

QM

GL

QM

Bloco

4

10,0

3

8,0

2

6,0

Genótipo

20

18,0

20

20,0

20

15,0

Erro

80

8,2

60

6,0

40

3,0

Média

10,0

12,0

15,0

 

                Apresente os resultados da análise de variância conjunta com os graus de liberdade de cada fonte de variação e, se possível, as respectivas somas de quadrado e quadrados médios.

 

                Um pré-requisito para analisar conjuntamente grupo de experimentos é a existência de homogeneidade de variâncias residuais entre eles. Neste caso, os QM dos erros não podem ser muito discrepantes. Uma recomendação prática, é dividir a maior e menor variância do erro, sendo que o resultando desta equação não pode ultrapassar 7 (80/40 = 2; <7).

 

Relação 1:

                A soma de quadrado dos resíduos da análise conjunta é o resultado da soma de todas as SQR para cada ambiente em estudo.

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image177.png

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image178.png

 

Relação 2:

                A soma de quadrado de genótipos dentro dos ambientes, obtida na análise conjunta, pode ser decomposta na soma entre SQG e SQGA. É também a soma das SQG de cada ambiente em separado.

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image179.png

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image180.png

 

FV/COMPONENTES

GL

SQ

QM

Bloco/ambiente

(4+3+2)= 9

76

8,444

Genótipo/Ambiente

(20 + 20 +20)= 60

1060

17,667

Genótipo

20

-

 

G x A

(20 x 2)= 40

-

 

Ambiente

2

985,25

492,625

Resíduo

(80 + 60 +40)= 180

1136

6,311

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image181.png

 

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image182.png

 

12) Considere um experimento de avaliação de g genótipos em a ambientes em blocos ao acaso com r repetições.

 

a)      Apresente o modelo estatístico para análise dos dados (descreva os efeitos).

 

Yijk = m + Gi + Aj +B/Akj + GAij + Eijk

Média = fixo;                                                    Genótipo (g) = aleatório;

Ambiente (a) = aleatório;                           Bloco (r) = aleatório;

Erro = aleatório                .

 

b) Apresente o quadro da ANOVA e respectivas E (QM), admitindo que todos os efeitos são aleatórios.

 

FV

GL

SQ

QM

E (QM)

Genótipo

g-1

SQG

QMG

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image142.png

Ambiente

a-1

SQA

QMA

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image144.png

Bloco/Ambiente

r(a-1)

SQB/A

QMB/A

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image140.png

G x A

(g-1) (a-1)

SQGA

QMGA

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image146.png

Resíduo

(r-1) (g-1)a

SQR

QMR

Descrição: C:\genetica_quant\Cap04_arquivos\image052.png

                                              

c) Como poderiam ser testadas as hipóteses: H0: δ²g = 0 e H0: δ²ga = 0 ?

 

Teste F (δ²g) = QMG / QMGA

Teste F (δ²ga) = QMGA / QMR

 

d) Como poderia ser estimado o componente de variância da interação genótipo x ambiente (δ²ga).

 

δ²ga = QMGA – QMR /r